法律是否允许预付工资时扣除3%的手续费？

预付工资扣除手续费不合法。依据《劳动法》，工资应按月支付给劳动者，不得克扣。扣除手续费可能损害劳动者权益，造成经济损失，应及时纠正。
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预付工资不应扣手续费。处理方式：1.与劳务公司协商，明确预付工资条款；2.若遭拒绝，收集证据，向劳动仲裁委申请仲裁；3.或依法向法院申请支付令，要求支付全额工资。
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预付工资扣手续费问题，应与劳务公司协商或申请劳动仲裁。若协商无果，劳动者可选择向劳动仲裁机构或法院申请支付令来维权。